氣相色譜質譜聯用儀GCMS主要應用：

1.環境分析

它可用于土壤、飲用水或廢水、空氣和污泥等多種樣品的分析。這些樣品可能含有許多不同的化合物，從非極性碳氫化合物到離子型有機金屬物質。農藥和除草劑，包括三嗪衍生物、氯酚、苯氧烷酸和磺酰脲類除草劑，都可以用液相質譜聯用設備進行分析，也可以用該設備分離多環芳烴和有機金屬化合物。  

2.遺傳病的生化篩選  

通過該設備分析新生兒的血液樣本，檢測代謝紊亂。目前，二級LC-MS檢測已用于確認新生兒篩查中的一級免疫檢測結果。  

3.藥物成分分析  

同時它還廣泛用于藥物成分的測定，特別是光學活性藥物的分離。藥物代謝產物具有化學或熱不穩定性，其檢測、分離和純化一般也用該設備。研究人員還利用色譜質譜儀對天然產物（如復合脂質、生物堿和不飽和脂肪酸）粗混合物中的組分進行分離和表征。  

4.類固醇激素分析  

氣相色譜質譜聯用儀GCMS分析有助于類固醇的生化研究，可測量婦女和兒童的二氫睪酮和睪酮水平。使用該設備可以簡化尿類固醇分析，因為這些類固醇主要以葡萄糖醛酸或硫酸鹽結合物的形式排出，需要水解和衍生化才能進行分析。